心灵感应军团和克拉克总统开始利用这些飞船的先进技术。克拉克政府的排外主义和极权主义日益盛行，并以军事事件为借口宣布戒严。这引发了火星的独立战争，而火星长期以来与地球的政治关系一直紧张。巴比伦5号也与其他几个地球联盟的外围殖民地一起宣布脱离地球独立。作为回应，地球联盟试图武力夺回巴比伦5号，但在与该空间站结盟对抗日益增长的暗影威胁的明巴利人的帮助下，这次进攻被击退。