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世纪之末，一场突如其来的洪水即将席卷Griffin岛。动物们在狮子领袖（Alan Stanford 配音）的带领下登陆一艘空前绝后的大船——诺亚方舟，不过不是所有动物都可以登上方舟。戴夫（德莫特·马格尼斯 配音）和芬尼（卡鲁姆·马龙尼 配音）是对呆萌可爱的喜欢旅行的父子，由于未在名单内，父子俩被禁止登陆方舟。为了躲避洪水，他们只好乔装打扮成小金狼，混上了方舟。却十分巧合的遇到了金狼母女海泽尔（Tara Flynn 配音）和利亚（艾娃·康纳利 配音）。好不容易蒙混过关，以为相安无事，但两个好奇的小宝贝却不慎跌出船外。于是，芬尼和利亚开始了一场寻亲之旅。期间，两个孩子从冤家变成朋友，用勇气和友情战胜洪水和野兽的袭击。与此同时，戴夫和海泽尔为了营救他们的孩子也在和傲慢的狮子斗智斗勇……